これ、本当にCE2で再生していますか?CEのウィンドウの内側で何か別のアプリが動いていて、それで動画や音声を再生している、ということはありませんか?
とりあえず手元で、「YouTubeのMP4動画」「別アプリでMP3に変換した音声」をそれぞれ下記3つの環境で再生させてみました。
・Google純正のChrome
・CE2
・Microsoft Edge
どの組み合わせでも、再生速度の選択肢は0.25刻みで選択できました。
とりあえずは「問題の動画」+「お手元のマシンとは別のメーカーのPC」+「ChromeまたはEdge」という組み合わせでどうなるか、試してみてください。